Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCBP3P57721 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCBP3P57721 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCBP3P57721 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCBP3P57721 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCBP3P57721 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCBP3P57721 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCBP3P57721 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCBP3P57721 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCBP3P57721 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCBP3P57721 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms