Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK1P57059 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK1P57059 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK1P57059 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms