Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HADHBP55084 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HADHBP55084 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HADHBP55084 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HADHBP55084 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HADHBP55084 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HADHBP55084 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HADHBP55084 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HADHBP55084 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HADHBP55084 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HADHBP55084 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HADHBP55084 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HADHBP55084 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HADHBP55084 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HADHBP55084 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHBP55084 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms