Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBP2P50120 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms