Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UTRNP46939 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTRNP46939 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTRNP46939 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UTRNP46939 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTRNP46939 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTRNP46939 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTRNP46939 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTRNP46939 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTRNP46939 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTRNP46939 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UTRNP46939 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
UTRNP46939 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UTRNP46939 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
UTRNP46939 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
UTRNP46939 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UTRNP46939 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UTRNP46939 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UTRNP46939 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTRNP46939 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UTRNP46939 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms