Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT2P45379 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms