Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCAMP43121 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCAMP43121 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCAMP43121 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MCAMP43121 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCAMP43121 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCAMP43121 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCAMP43121 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCAMP43121 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCAMP43121 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCAMP43121 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCAMP43121 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCAMP43121 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MCAMP43121 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCAMP43121 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCAMP43121 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCAMP43121 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCAMP43121 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCAMP43121 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCAMP43121 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCAMP43121 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCAMP43121 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms