Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms