Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA2P42262 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms