Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC26A3P40879 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms