Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms