Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
BMI1P35226 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BMI1P35226 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BMI1P35226 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BMI1P35226 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BMI1P35226 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms