Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms