Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP1P30622 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP1P30622 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms