Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRABP1P29762 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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