Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LOXP28300 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LOXP28300 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LOXP28300 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LOXP28300 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LOXP28300 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LOXP28300 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LOXP28300 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LOXP28300 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LOXP28300 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LOXP28300 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LOXP28300 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LOXP28300 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LOXP28300 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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