Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms