Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRBP23467 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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