Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSHP23434 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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