Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNOP22674 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNOP22674 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms