Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGA2P17301 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms