Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD46P15529 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD46P15529 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD46P15529 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD46P15529 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD46P15529 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD46P15529 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD46P15529 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD46P15529 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD46P15529 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD46P15529 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD46P15529 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD46P15529 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD46P15529 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD46P15529 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD46P15529 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD46P15529 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD46P15529 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD46P15529 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD46P15529 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms