Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL2P13500 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL2P13500 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL2P13500 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL2P13500 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL2P13500 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL2P13500 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL2P13500 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL2P13500 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL2P13500 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL2P13500 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL2P13500 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL2P13500 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL2P13500 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL2P13500 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL2P13500 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL2P13500 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL2P13500 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL2P13500 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms