Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDH1P12830 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH1P12830 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms