Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCNAP12004 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCNAP12004 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCNAP12004 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCNAP12004 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCNAP12004 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCNAP12004 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCNAP12004 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms