Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSIG8P0DPA2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms