Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C8orf89P0DMQ9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms