Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2BP0DI82 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms