Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC2P0DI81 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms