Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF853P0CG23 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF853P0CG23 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms