Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM228BP0C875 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms