Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NGFRP08138 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NGFRP08138 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NGFRP08138 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms