Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCATP04180 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LCATP04180 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCATP04180 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCATP04180 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCATP04180 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCATP04180 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCATP04180 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCATP04180 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCATP04180 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCATP04180 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCATP04180 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms