Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX58O95786 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX58O95786 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX58O95786 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX58O95786 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX58O95786 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX58O95786 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX58O95786 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX58O95786 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX58O95786 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX58O95786 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX58O95786 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX58O95786 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX58O95786 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX58O95786 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms