Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABARAPO95166 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms