Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALX3O95076 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALX3O95076 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALX3O95076 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALX3O95076 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALX3O95076 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALX3O95076 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALX3O95076 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALX3O95076 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALX3O95076 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALX3O95076 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALX3O95076 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALX3O95076 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALX3O95076 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALX3O95076 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms