Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F6O75461 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms