Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALUO43852 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALUO43852 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALUO43852 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALUO43852 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALUO43852 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALUO43852 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALUO43852 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALUO43852 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALUO43852 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALUO43852 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALUO43852 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms