Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CRXO43186 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CRXO43186 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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