Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRTO14522 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
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