Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms