Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP17L13C9JLJ4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L13C9JLJ4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L13C9JLJ4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L13C9JLJ4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L13C9JLJ4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L13C9JLJ4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L13C9JLJ4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L13C9JLJ4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L13C9JLJ4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L13C9JLJ4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L13C9JLJ4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP17L13C9JLJ4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP17L13C9JLJ4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms