Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DXG7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DXG7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DXG7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DXG7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DXG7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DXG7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DXG7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DXG7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DXG7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DXG7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DXG7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
B4DXG7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
B4DXG7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms