Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CYSRT1A8MQ03 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms