Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARID3CA6NKF2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3CA6NKF2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms