Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA6L9A6NEM1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA6L9A6NEM1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms