Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf49A4QMS7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms