Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms