Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms