Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPRKBQ9Y3C4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms